激光切割加工有專業的計算機輔助數控程序編程軟件，編制零件加工程序的工作一般在離線計算機上完成。有些簡單的加工程序也可以直接在數控系統的編輯界面完成，但需花費較長時間，且無法進行復雜零件的編程排樣。一般不提倡在數控系統上進行數控程序的編制，因為這將占用大量的機床使用時間，而且效率低下。在板料放置在機床工作臺上之后，重要的工作是確定機床加工工件的坐標系，這個加工工件的坐標系應當與數控編程中設置的坐標系完全一致。
注意在開始加工后，有一個試切階段，在這個階段操作者應當觀察加工情況，及時調整加工的參數，對于批量加工尤其重要。
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